Su arıtma sistemlerinde kullanılan otomasyon sistemleri; zaman kontrollü, hacim kontrollü veya basınç kontrollü olarak çalışmaktadır. Sistemin ne amaçla kullanılacağına, kurulacak otomasyon sistemi kapasitesine, çevresel etkilere ve yatırım maliyetine bağlı olarak değişik otomasyon sistemleri tercih edilir. Ülkemizde en çok tercih edilen otomasyon sistemleri Fleck marka zaman ve hacim kontrollü otomasyon sistemleridir. En yaygın kullanılan modeller ise 5600, 2750, 2850, 2900, 3150, 3900, 9000, 9500, 2900 dublex, 3900 dublex, 2900 ve 3900 triplex sistemlerdir. Bu sistemler 3 m3/saat kapasiteden, tek sistemde 100 m3/saat’ e ulaşabilmektedir. Sistemax kontrol üniteleri ile büyük sistemlerin merkezi kontrolü sağlanmakta ve tek kontrol noktasından birden fazla sistem kontrol edilebilmektedir. Fleck valflerin alternatifi ise Autotrol ve Siata otomasyon valfleridir. Bu sistemlerde Fleck valflere yakın çalışma özellikleri taşır. Özellikle daha büyük kapasiteli sistemlerde ise pnömatik sistemler tercih edilmektedir. Bunun en temel nedeni ise otomasyon valflerinde, özellikle Fleck valflerde 3” üzerinde ürün olmamasıdır.